Publications (en français)


VULGARISATION

Assembler un génome sur un pico-ordinateur
D. Lavenier, BioFutur, VOL 34/363, pp.52-56, 2015 [link]

Assembler un génome sur Raspberry Pi, Emergence, Lettre d’information INRIA, no 29, 2013 [link]

INRIA, KoriPlast : un logiciel pour exploiter les bases de données génomiques, 2011 [link]

J.-M. Primat, D. Lavenier, Un logiciel qui accélère le mapping génétique, 2011 [link]

D. Lavenier, La puissance des cartes graphiques au service de la bioinformatique, Les Cahiers de l’ANR: le calcul intensif, 2010 [pdf] [link]

D. Lavenier, Plus besoin de dévaliser les banques, Journal du CNRS (no 182 – mars), 2005 [link]

A. Lefèvre-Balleydier, D. Lavenier, Staphylocoque doré : variations sous haute surveillance, Journal du CNRS (no 188 – septembre), 2005 [link]

D. Lavenier, Accélérer l’exploration et l’analyse des textes des génomes, Interstices, 2005 [link]

D. Lavenier, SAMBA, pour diviser par 100 les temps d’analyse des séquences génomiques, Archives du CNRS, 1997 [link]

D. Lavenier, SAMBA: Accélérateur matériel pour la comparaison de séquences biologiques, Les 100 Faits Marquants du Département SPI, CNRS, 1997 [pdf]

LIVRES

D. Lavenier, M. Daumas, Architectures des Ordinateurs , Technique et Science Informatiques, vol 25, num 6, 2006

D. Lavenier, M. Auguin, Architectures des Ordinateurs , Technique et Science Informatiques, vol 24, num 6, 2005

D. Lavenier, D. Litaize, Architectures des Ordinateurs , Technique et Science Informatiques, vol 20, num 1, 2001

D. Lavenier, J. Quinqueton, Architectures Reconfigurables , Technique et Science Informatiques, vol 18, num 1, 1999

T. Bernard, D. Lavenier, E. Martin, B. Pottier, FPGA et SMARTS SENSORS, Calculateurs Parallèles, vol 9, num 1, 1997

REVUES

M. Darouich, S. Gyuétant, D. Lavenier, Etude quantitative dálgorithmes de stéréovision pour les systèmes embarqués d’aide à la conduite, Technique et Science Informatiques, vol 30, no 5, 2011 [link]

D. Lavenier, RDISK : une architecture reconfigurable pour l’exploration des banques génomiques, Technique de l’ingénieur, vol Novembre, no IN89, 2008 [link]

M. Giraud, S. Guyétant, D. Lavenier, Encodage Linéaire d’automates pondérés. Filtrage de motifs génomiques et application sur l’architecture prototype R-disk, TSI, vol 24, no 6, 2005 [link]

R. David, D. Lavenier, S. Pillement, Du micro-processeur au circuit FPGA, TSI, vol 24, no 4, 2005 [link]

F. Raimbault, D. Lavenier, ROOM : des machines reconfigurables orientées objet pour les applications spécifiques, TSI, vol 22, no 6, 2003

D. Lavenier, Parallélisation de l’algorithme du K-means sur un système reconfigurable. Applications aux images hyper-spectrales, Traitement du Signal, vol 18, no 5/6, 2001

S. Rubini, D. Lavenier, Les Architectures Reconfigurables, Calculateurs Parallèles, vol 9, no 1, 1997 [pdf]

L. Audoire, JJ. Codani, D. Lavenier, P. Quinton, Machines spécialisées pour la comparaison de séquences biologiques, TSI, vol 14, no 1, 1995 [pdf]

D. Lavenier, Architectures parallèles pour la comparaison de séquences biologiques, Calculateurs Parallèles, vol 6, no 4, 1994 [pdf]

F. Raimbault, P. Quinton, D. Lavenier, Architectures Systoliques et Parallélisme de données; l’environnement de programmation ReLaCS, TSI, vol 11, no 5, 1993 [pdf]

D. Lavenier, Initiation à la conception de circuits à la demande avec SOLO 2000, Annales des télécommunications, vol 46, no 9-10, 1991

CONGRES

M. Darouich, S. Guyétant, D. Lavenier, Unité flexible de calcul de disparité pour l’aide à la consuite, Symposium en Architecture de machines (SympA’13), Toulouse, France, 2009 [pdf]

V.H. Nguyen, D. Lavenier, Comparaison intensive des séquences protéiques : indexation des banques et usage des instructions SIMD des microprocesseurs, JOBIM 2008, Lille, France, 2008 [pdf]

Van Hoa Nguyen, D. Lavenier, Parallélisation de la recherche de similarités entre séquences protéiques sur GPU, RenPar 18 : Rencontres francophones du Parallélisme, Fribourg, Suisse, 2008 [pdf]

P. Veber, S. Tempel, R. Andonov, D. Lavenier, J. Nicolas, Détection de domaines dans des séquences génomiques : un problème de couverture optimale, Conférence scientifique conjointe en recherche opérationnelle et aide à la décision, Grenoble, France, 2007 [pdf]

G. Georges, S. Derrien, S. Rubini, F. Raimbault, L. Amsaleg, D. Lavenier, ReMIX: une architecture pour la recherche dans les masses de données indexées, Sympa 2006, Symposium en Architecture de Machines, Perpignan, France, 2006 [pdf]

V. H. Nguyen, D. Lavenier, Recherche dans les banques d ADN par indexation parallèle, 4th International Conference on research, innovation & vision for the future, Ho Chi Minh Ville, Vietnam, 2006 [pdf]

M. Giraud, Recherches de motifs et de similarités en bioinformatique : modélisations, solutions logicielles et matérielles (tutoriel), Majestic 2005, Rennes, 2005 [pdf]

N. Ben Zakour, D. Lavenier, M. Gautier, Y. Leloir, Utilisation de l indexation de séquences et du calcul thermodynamique pour optimiser la spécificité des oligonucléotides, JOBIM 2005, Lyon, 2005 [pdf]

M. Giraud, P. Quignon, E. Retout. E. Morin, AS. Valin, D. Lavenier, M. Rimbault, F. Galibert, J. Nicolas, Assemblage ciblé : recherche d une famille de gènes sur un génome non assemblé, JOBIM 2005, Lyon, 2005 [pdf]

F. Raimbault, D. Lavenier, Le parallélisme de classe, RenPar 15 : 15ème Rencontres Francophones du Parallélisme , La Colle sur Loup, 2003 [pdf]

S. Guyétant, D. Lavenier, Filtrage de bases de données sur le prototype RDISK, SympAAA 2003, 9ème Symposium en Architectures de Machines et Adéquation Algorithme Architecture, La Colle sur Loup, 2003 [pdf]

M. Giraud, D. Lavenier, Réalisation matérielle d automates pondérés pour la recherche de motifs génomiques, SympAAA 2003 : Symposium en Architectures de Machines et Adéquation Algorithme Architecture, La Colle sur Loup, 2003 [pdf]

R. Andonov, D. Lavenier, N. Yanev, P. Veber, Fragmentation de génomes bactériens : deux approches d optimisation combinatoire, Roadef 2003, Avignon, France, 2003 [pdf]

D. Lavenier, H. Leroy, M. Hurfin, R. Andonov, L. Mouchard, F. Guinand, Le projet GénoGRID : une grille expérimentale pour la génomique, JOBIM 2002, Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématique, Saint Malo, France, 2002 [pdf]

F. Raimbault, D. Lavenier, ROOM : des machines reconfigurables orientés objet, SympA 8 : 8ème Symposium en Architectures Nouvelles de Machines, Hamamet, Tunisie, 2002 [pdf]

S. Guyétant, S. Derrien, D. Lavenier, Architecture parallèle pour la génomique, SympA 8 : 8ème Symposium en Architectures Nouvelles de Machines, Hamamet, Tunisie, 2002 [pdf]

E. Fabiani, D. Lavenier, Stratégie de Placement de réseaux linéaires sur circuits FPGA, 7ème Symposium en Architectures Nouvelles de Machines, Paris, France, 2001 [pdf]

D. Lavenier, C. Wagner, Conception d’un réseau systolique à partir de C-stolic : application à la biologie moléculaire, 4ème Symposium en Architectures Nouvelles de Machines, Rennes, France, 1996 [pdf]

P. Frison, E. Gautrin, D. Lavenier, JL. Scharbarg, Réseaux spécifiques à base du processeur API15C, 2ème Symposium en Architectures Nouvelles de Machines, Toulouse, France, 1990

Comments are closed.