PhD Students

Current PhD Students

  • Lolita Lecompte
    • Detection of structural variants (2017-2019)
  • Pham Hoang Son
    • Datamining and bioinformatics (2015-2017)
  • Gaetant Benoit
    • Analyze of large metagenomics datasets (2015-2017)

Former PhD Students

  • Antoine Limasset , Post-Doc Université libre de Bruxelles, Belgium
    • Novel approaches for the exploitation of high throughput sequencing data, 2017 (link)
  • François Moreews, INRA Engineer
    • Concevoir et partager des workflows d’analyse de données. Application aux traitements intensifs en bioinformatique, 2015 (link)
  • Nicolas Maillet, Researcher at Pasteur Institute
    • Comparaison de novo de données de séquençage issues de très grands échantillons métagénomiques : application sur le projet Tara Oceans, 2013 (link)
  • Guillaume Chapuis, Post-Doc LANL, USA
    • Exploiting parallel features of modern computer architectures in bioinformatics : applications to genetics, structure comparison and large graph analysis, 2013 (link)
  • Rayan Chiki, CNRS Researcher, INRIA Lille
    • Computational Methods for de novo Assembly of Next-Generation Genome Sequencing Data, 2012 (link)
  • Guillaume Rizk, CEO AlgoRizk company, Paris
    • Parallelization on graphic hardware: contributions to RNA folding and sequence alignment, 2011 (link)
  • Mehdi Darouich, CEA researcher, Saclay
    • REEFS: une architecture reconfigurable pour la stéréovision embarquée en contexte temps-réel, 2010
  • Van Hoa Nguyen, Assistant Professor, An Giang University, Vietnam
    • Traitement Parallèle des Comparaisons Intensives de Séquences Génomiques, 2009
      (link)
  • Nicolas Ventroux, CEA Researcher, Saclay
    • Contrôle en ligne des systèmes multiprocesseurs hétérogènes embarqués : élaboration et validation d’une architecture, 2006 (link)
  • Mathieu Giraud, CNRS Researcher, INRIA Lille
    • Architectures reconfigurables pour la recherche par automates de motifs dans les séquences génomiques, 2005 (link)
  • Stéphane Guyétant, Engineer, VisonObjects Company, Nantes
    • Architecture parallèle reconfigurable pour le filtrage des banques de données non structurées : application à la génomique, 2004 (link)
  • Erwan Fabiani, Associate Professor, University of Brest
    • Implémentation automatique de réseaux réguliers sur circuits reconfigurables, 2001 (link)
  • Pascale Guerdoux-Jamet
    • Mise en oeuvre de logiciels de comparaison de séquences biologiques sur des machines spécialisées systoliques. Application à l’analyse de génomes, 1997 (link)
  • Marc Viellot
    • Mise en oeuvre de l’operateur Gamma à l’aide de circuits logiques reconfigurables, 1996
  • Roderick McConnell, Engineer, Infineon Company, Munich
    • Systèmes VLSI synchrones périodiques : modélisation et application, 1994 (link)
  • Frédéric Raimbault, Associate Professor, University of Vannes
    • Etude et réalisation d’un environnement de simulation parallèle pour les algorithmes systoliques, 1994 (link)

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