PhD Students
Current PhD Students
Former PhD Students
- Lolita Lecompte
- Detection of structural variants (2017-2020)
- Pham Hoang Son , Post doc, Université Catholique de Louvain
- Novel Pattern Mining Techniques for Genome-wide Association Studies, 2017 (link)
- Gaetant Benoit
- Métagénomique comparative de novo à grande échelle, 2017 (link)
- Antoine Limasset , CNRS Researcher, Lille
- Novel approaches for the exploitation of high throughput sequencing data, 2017 (link)
- François Moreews, INRA Engineer
- Concevoir et partager des workflows d’analyse de données. Application aux traitements intensifs en bioinformatique, 2015 (link)
- Nicolas Maillet, Researcher at Pasteur Institute
- Comparaison de novo de données de séquençage issues de très grands échantillons métagénomiques : application sur le projet Tara Oceans, 2013 (link)
- Guillaume Chapuis
- Exploiting parallel features of modern computer architectures in bioinformatics : applications to genetics, structure comparison and large graph analysis, 2013 (link)
- Rayan Chiki, Pasteur Institute Researcher, Paris
- Computational Methods for de novo Assembly of Next-Generation Genome Sequencing Data, 2012 (link)
- Guillaume Rizk, Enancio company, Rennes
- Parallelization on graphic hardware: contributions to RNA folding and sequence alignment, 2011 (link)
- Mehdi Darouich, CEA researcher, Saclay
- REEFS: une architecture reconfigurable pour la stéréovision embarquée en contexte temps-réel, 2010
- Van Hoa Nguyen, Assistant Professor, An Giang University, Vietnam
- Traitement Parallèle des Comparaisons Intensives de Séquences Génomiques, 2009
(link)
- Nicolas Ventroux, CEA Researcher, Saclay
- Contrôle en ligne des systèmes multiprocesseurs hétérogènes embarqués : élaboration et validation d’une architecture, 2006 (link)
- Mathieu Giraud, CNRS Researcher, INRIA Lille
- Architectures reconfigurables pour la recherche par automates de motifs dans les séquences génomiques, 2005 (link)
- Stéphane Guyétant, Engineer, VisonObjects Company, Nantes
- Architecture parallèle reconfigurable pour le filtrage des banques de données non structurées : application à la génomique, 2004 (link)
- Erwan Fabiani, Associate Professor, University of Brest
- Implémentation automatique de réseaux réguliers sur circuits reconfigurables, 2001 (link)
- Pascale Guerdoux-Jamet
- Mise en oeuvre de logiciels de comparaison de séquences biologiques sur des machines spécialisées systoliques. Application à l’analyse de génomes, 1997 (link)
- Marc Viellot
- Mise en oeuvre de l’operateur Gamma à l’aide de circuits logiques reconfigurables, 1996
- Roderick McConnell, Engineer, Munich
- Systèmes VLSI synchrones périodiques : modélisation et application, 1994 (link)
- Frédéric Raimbault, Associate Professor, University of Vannes
- Etude et réalisation d’un environnement de simulation parallèle pour les algorithmes systoliques, 1994 (link)